Hoewel het Educatief Magnetisch Doolhof Speelgoed veel positieve aspecten kent, zijn er ook enkele aandachtspunten. Allereerst is het formaat van 30 x 26,4 centimeter redelijk compact, maar voor sommige kinderen kan het bord relatief klein aanvoelen. Dit kan de speelmogelijkheden beperken wanneer meerdere kinderen tegelijk willen spelen of wanneer een kind meer ruimte nodig heeft om de balletjes te bewegen. Meer ruimte of een groter formaat zou soms prettig zijn.
Daarnaast kan het magnetische systeem soms iets minder krachtig zijn, vooral wanneer balletjes kleven aan het hout of wanneer de magneetstaaf niet goed gepositioneerd wordt. Dit vraagt soms wat oefening en geduld van jonge kinderen, wat kan leiden tot frustratie bij peuters die nog niet helemaal de fijne motoriek beheersen.
Verder is het aantal speelmogelijkheden beperkt tot het magnetisch verplaatsen van balletjes en het tellen van cijfers tot 10. Voor kinderen die sneller leren of al wat ouder zijn dan 4 jaar, kan het spel snel te eenvoudig worden. Het speelgoed biedt geen extra uitbreidingsmogelijkheden of variaties, waardoor de speelduur op de lange termijn beperkt kan zijn.
Hoewel het hout een duurzame uitstraling geeft, kan het natuurproduct gevoeliger zijn voor vocht of stoten dan bijvoorbeeld kunststof alternatieven. Dit betekent dat het speelgoed extra voorzichtig behandeld moet worden om beschadiging te voorkomen, wat soms lastig kan zijn bij zeer jonge kinderen.